1999年2月発表。1998年度の軽自動車規格変更によって、ボディサイズが拡大した。トラック、バン、ディアス（4ナンバー）のラインナップで登場。エンブレムは当時の他のスバル車同様に専用のエンブレムが装着された。スーパーチャージャー車の出力が58psに向上。NAはキャブレター仕様を廃止。
1999年10月、ディアスワゴンクラシック（5ナンバー）追加。3速ATのみ。
2001年8月、一部改良。フロントターンシグナルをクリアーに変更、NAエンジンの出力を48psに向上。これに伴い全車がシリンダーヘッド内のロッカーアームがニードルローラーベアリングを用いたローラーロッカーアームに変更され、フリクションロスが低減した。ディアスワゴンクラシックのNA車にMTを設定。
2002年9月、最初のマイナーチェンジ。フロントマスクのデザインを変更しヘッドランプがマルチリフレクター化され、六連星エンブレムを再び装着した。バックドアガラスが拡大され、Hゴム支持から接着式へ変更。5ナンバー仕様が「ディアスワゴンクラシック」から「ディアスワゴン」となり、シリーズ統一の顔となる。同時にスーパーチャージャー車にもMTを設定。バンシリーズのスーパーチャージャー車を廃止。
2003年11月、一部改良。バンシリーズの「ディアス」を廃止、「VC plus」を追加。トラックに「TC Professional」を追加。
2005年11月、2度目のマイナーチェンジ。フロントマスクのデザインが再び変更され、メーターパネルのデザインも変更。オドメーターが液晶化され、全車に液晶式のツイントリップメーターが標準装備となる。バンシリーズの「ディアス」が復活。
2007年12月6日、ディアスワゴンの販売再開。あわせてマイナーチェンジを実施し、UV&IRカットガラスや消臭ルーフトリム、クリアーターンレンズなどを採用。新カラー追加や内装色の変更、後席居住性の向上などが施された。また、新規排ガス規制に対応させた。
2008年7月18日、一部改良。ディアスワゴンにメッキタイプのフロントグリル、運転席＆助手席乗降用グリップ、パワーウインドゥ、フューエルリッドオープナー、ミスト付2速フロントワイパー、フロントバンパープロテクタ、ビニールレザー素材の新シート表皮、アンサーバック機能付電波式リモコンドアロック、CDプレーヤー&AM/FM電子チューナー一体オーディオ、シートベルトリマインダー、デュアルSRSエアバッグなどを採用（エクステリア、インテリアとも採用装備は車種やグレードによって違いあり）。 そのほか、全車が「平成19年排出ガス規制認可」を取得、新ボディ色「スターリングシルバー・メタリック」を新設定など。
2009年9月3日、4ナンバー車（商用グレード）のみのマイナーチェンジ。フロントマスクがグリルレスのデザインとなり、インパネ周りの意匠も変更された。バンの「ディアス」と「トランスポーター」にスーパーチャージャー仕様を新たに設定。ディアスバンでは大型の電動ドアミラーとドアトリムを標準装備とし、同じくディアスバンのスーパーチャージャー仕様にはタコメーターも標準装備となった。5ナンバー車（乗用グレード）の「ディアスワゴン」については、ダイハツ工業からのOEM供給に移行した

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